センター開設後、積極的かつ専門的な膵切除（膵頭十二指腸切除、膵体尾部切除、膵全摘、血管合併切除など）を行っています。
難易度の高い膵臓・胆道手術のなかでも、膵切除はとりわけ難しい手術でありますが、センター長の藤井教授が開発した新しい膵空腸吻合法：Blumgart変法を導入することで、安全かつ確実な手術を行うことができています。 （Fujiiら、2014年論文化）
2019年以降、毎年100件を 超える膵切除を行なっています。 これは北陸４県で最多です。

膵頭十二指腸切除術後の晩期合併症として、胆管空腸吻合部狭窄による胆管炎があります。これを予防するため、吻合径を拡張する新たな吻合方法：T吻合を開発しました。（Kimuraら、2023年論文化）T吻合を行ったグループと従来の吻合法を行ったグループを比較すると、T吻合を行ったグループで術後胆管炎の発症率が有意に減少しました。

広く大きく切除をすることのみが最善の治療とは限りません。近年は病気の悪性度や進行度に合わせた必要十分な治療についても開発が進んでおり、ロボット支援下膵切除術（ロボット手術）はその代表的なものです。
これまでは病気が進行していなくても、進行がんと同様に上腹部からおへそまで大きく開腹が必要でしたが、病状･病態にあわせてロボット手術を行うことで創部を小さくし、患者様の体の負担を最小限にする手術にも積極的に取り組んでいます。また、体表の創部だけでなく、切除する臓器を最小限にすることも考慮しています。
普段は膵臓と共に切り取られる脾臓を残したり、半分近く切り取られる膵臓の量を1/3程度に抑えることで、将来免疫能が低下したり、糖尿病になったりするリスクを最小限にすることも考慮しています。当センターでは、2020年に北陸初となるダビンチによる膵切除を導入しました。